林木種子質量好壞，直接影響到育苗的成敗，因此在采收林木種子和育苗前應該對林木種子質量進行嚴格的檢驗。檢驗方法如下：
肉眼觀察法：（1）新鮮成熟的林木種子表面光亮、顏色新鮮，如馬尾松種子呈灰褐色、或灰棕色；油松種子呈深灰色或灰褐色；杉木種子呈黃褐色或栗褐色；（2）將種子浸入水中一天，待其膨脹后用刀沿腹縫線切開，觀看種胚、胚乳和子葉的顏色、狀態、液汁及氣味是否正常。
如發育正常的種子，種胚和胚乳豐滿并呈乳白色。比如馬尾松的種子為淡白色且油分多；杉木種子胚為淡紅白色。發育不良和陳舊種子的種胚多為黃、黑色，油分不足、質硬、腐爛發霉或成粉狀；有的種子種胚顏色正常，但子葉呈暗褐或黑色，也不能用來播種。
鼻嗅法：許多林木種子都具有一種特殊的氣味，如松類、柏樹種子常帶有松脂和松節油的氣味，若發出糜爛氣味，說明種子已爛，不宜選作種用。
沉浮法：一般好種子比重大會下沉，壞的癟的種子浮在水面上，據此來檢驗種子的質量。但如松、杉樹種子比水輕，好壞種子均上浮，可在檢驗水中加入適量的酒精；相反有的種子比重比水大，壞種子也會下沉，可在檢驗水中加入3—5%的食鹽，這樣增加水的浮力，壞種子較好種子輕，就會浮在水面上了。
用耳聽：對油桐、栓櫟等大粒種子，在種子堆中任意抓一把搖晃，如有響聲，說明種子干癟、不飽滿，發芽率不高，生活力低。
用火炒：將少量種子放入鍋中或在鐵板上加熱炒，凡能發出爆響的種子均可以發芽，但爆響得快，爆響聲大的種子質量更好。相反的則說明種子質量差，生活力弱，即使能發芽出苗，其樹苗長勢也弱，不宜采用。
壓榨種子觀察：先將香椿種子浸在水中10-12小時，再用破片壓榨，壓擠出白漿者是良種，如壓擠只出水或氣泡的，則是質量差的種子，不能選為種用。
各地可以因地制宜，任意選用上述的一種或兩種方法，對林木種子作認真的檢驗，可以識別優劣，選優去劣，選取優良的林木種子供生產用。
